Dalam Voxel Bot, Anda bermain sebagai robot yang harus membersihkan semua kubus di level. Dengan melompat dari kubus ke kubus, Anda mengubah warna kubus, dan ketika semua kubus berwarna ungu, Anda menyelesaikan level. Untuk mempersulit tujuan Anda, ada musuh yang tidak bisa Anda sentuh atau mencoba menangkap Anda. Untuk membuatnya lebih menantang lagi, ada paku yang menyerang saat Anda terlalu lama diam di atas kubus. Level-level akan menjadi lebih kompleks seiring kemajuan permainan. Mekanisme baru akan diperkenalkan seperti kubus hijau yang akan memungkinkan Anda bergerak lebih jauh dan kubus yang bisa padat atau tidak padat dengan menekan tombol.